在科研取得突破的同时，计算所也根据变化了的情况对组织结构先后做了调整。1962年12月间，所领导对发展壮大了的人员和规模重新理清了思路，调整或新设了第九、十、十一、一、七研究室，分别专门从事理论研究、专用机研究、组合元件及超低温技术、微波技术和隧道二极管线路、结构工艺研究设计。1965年7月，经院党组批准，计算所首次成立“二部”，专门负责微型计算机的研制调试工作。

　　“文革”初期，1968年3月14日，在名为“加强中国人民解放军第十研究院的科研力量”的决定下，自此到1975年6月，计算所划归国防科委领导，代号1013研究所，部队番号京字116部队。

　　这个时期主要是为国防任务研制配套使用的计算机。到六十年代末，随着国际上集成电路计算机的迅速发展，计算所也把计算机电路技术推向了第三代，并于1971年研制出了111型数字计算机，它采用饱和型小规模集成电路，它是我国第一批研制成功的第三代计算机。在这期间研制的另一台013大型通用数字计算机，在国内大型计算机中首次采用电流开关逻辑集成电路，为后来国内大型计算机普遍采用电流开关逻辑电路提供了经验。伴随着计算机研究、设计、制造工作的需要，从七十年代初期开始，在所内新开拓了计算机辅助设计（CAD）、辅助测试（CAT）、辅助制造（CAM）这一计算机重要应用领域的研究工作。在数值计算和应用方面，发展到七十年代中期，研究队伍更加成熟，并做出了大量研究成果：为我国航天事业、飞机制造业、船舶制造业、建筑业和电子工业多方面的产品设计提供了算法及其软件；为交通运输、文教、卫生事业解决了许多计算问题；完成了人工合成胰岛素、全国天文大地网首次整体平差等重大科学计算任务；并在初边值问题差分方法和绕流计算方面取得了具有国际先进水平的成果，曾获得国家自然科学三等奖。

　　1975年6月20日，国务院考虑到科学技术发展需要，1013所（即计算所）重新划归中科院领导。

　　三、坚持改革开放，自主发展，为国家经济建设做贡献

　　1978年春“全国科学大会”的召开给全国科技界带来了春风。在“科学的春天”的阳光照耀下，计算技术研究步入了新的发展时期；跨入八十年代后，科研工作更因改革开放呈现出蒸蒸日上的局面。近十多年来，我国科技政策不断深化。“经济建设要依靠科学技术，科学技术要面向经济建设”给科技工作指出了前进方向。“把科学院主要科技力量动员组织到为国民经济服务的主战场”使我们的努力目标更加具体化。中国科学院两种运行机制明确了不同性质科研工作不同发展模式和要求。

　　一方面，计算所继续研制新型计算机系统并取得了重大成果。1983年通过国家鉴定的757大型通用数字计算机系统，采用了国内首先提出纵横加工流水线向量机的设计思想，是我国自行研制成功是第一台大型向量数字计算机系统，是我国大型计算机研制水平提高的一个重要标志，执行向量计算平均每秒1000万次左右，标量计算平均每秒280万次左右；鉴定考核全系统使用效率99.8%，主要技术指标和可靠性指标达到了国内先进水平，分别于1984年和1985年获得中科院科技进步特等奖、国家科学技术进步一等奖。1981年完成的150-AP高速数据处理机，在使用中为提高使用中为提高石油地震勘探资料处理的效率和精度取得了明显的效果，它与150通用数字计算机联机运行时，处理地震资料的效率是150计算机单独使用时的2-7倍。近几年研究开发的几个汉字微型计算机系统各具特色，作为微型计算机产品已经小批量生产。

　　同时，计算所在发展计算机新技术方面继续攀登，获得了一批技术难度大的高技术成果。1985年通过国家鉴定的200MB磁盘盘组以及200MB磁盘组伺服盘刻划装置具有我国当前这种装置和技术的最先进水平。1982年研制成功并由产业部门定型生产的ZDC207型半英寸带宽具有每英寸800位/1600位双密度记录的磁带机达到了国际上同类产品水平，获得了1983年国家产品银质奖。数字系统设计自动化的研究工作在系统模拟、逻辑综合与逻辑模拟、逻辑划分、布局与布线、插件板故障自动测试、电路分析、版图设计、陈列逻辑最优自动设计等方面取得了明显的应用效果，在国内起着技术领先作用。产生数字电路测试码的算法“主路径敏化法”获得了1982年国家自然科学四等奖。在汉字信息处理中的字库谱系的建立有了统一的解决方法。在操作系统、网络软件、绘图软件、软件开发环境方面也取得了一批先进的实用性成果。

　　除此以外，计算所还在计算机科学技术的基础理论研究工作做出了重大贡献。在自动机理论、程序设计理论、可计算性理论以及计算复杂性理论方面发表了一系列有创见性的论文和专著，在国内外产生了不同程度的影响。

　　随着改革开放不断深化，计算所面临着重大变革。一是处于由计划经济向社会主义市场经济体制变革时期，科研任务来源和服务对象发生了根本变化。由国家拨款计划下达大型机研制任务，为国家一些重大建设项目和国防工程服务的时代过去了，要靠自己的实力去争取任务和经费。二是处于计算机国内外激烈竞争环境当中，计算所的历史地位和作用发生了变化。国际上飞速发展的计算机技术和先进产品，国内计算机同行形成群体且不断壮大发展，促使计算所必须找出差距，摆正位置，调整科研方向，迅速增强自己的科技与经济实力，才能在激烈的竞争中立足、取胜和更好地发展。

　　尤其是最近十多年来，计算所一直按照国家的科技改革政策推动和不断变革自己的工作。自觉地增强自主发展意识和能力，转变思想观念，调整科研体制，增加新生力量，发挥全所整体优势，面向国内外市场，扩大应用服务范围，多渠道争取任务，积极组织创收，探索出了一条自主发展的新路。在这个时期里，取得了一批有显示度的成绩。1983年GF20/11A汉字微机系统通过鉴定，这是我国第一台在操作系统核心部分进行改造的汉字系统，并配置了汉化的关系数据库系统，使我国的汉字处理从BASIC语言的汉字字符串时代进入了汉字数据库时代，大大推动了办公自动化等应用系统的发展。1984年起与石油部所属有关研究院所合作共同研制KJ8920大型数据处理系统和开发石油应用软件，为石油应用部门服务，此项成果分别获得了1992年、1993年中科院和国家两个科技进步一等奖。1990年与中科院软件所、自动化所共同研制的CAS386微机工作站和微机系统，使微机达到了工作站的水准，具有廉价、易用和功能强等优点，1991年、1992年分别获中科院科技进步一等奖和国家科技进步二等奖，并入选《计算机世界》和《中国计算机报》1990年国内十大事件及《中国科学报》1990年国内十大科研成果评选。把机器翻译基础性研究成果利用外资和国际合作及时转化为“快译通”产品推向市场，取得了显著经济效益，并与1993和1995年分别获中科院和国家两个科技进步一等奖。计算所也时时不忘自身国家科研机构的身份，在事关国民经济整体规划的事业上也投入了很大精力，取得了良好的社会效益。在计算机与通信结合，开发网络应用工程的尝试中，完成了中关村科研教育示范网、宁波市六家银行一家保险公司金融网络系统、中国科学院百所联网等建网任务，为促进国民经济信息化进程做出了贡献。计算所还大力推广计算机的普及应用，面向社会开发计算机应用工程，重点在商业、税务、石化、电力部门建立一支既掌握计算机技术又了解用户行业业务的具备双重知识结构的专业技术队伍。

　　在多年的成长历程中，计算所一方面发展壮大了自己；一方面部分学科不断深入细化，以至成熟，由此而生发出若干独立的个体。从这个意义上讲，计算所确实是我国计算机事业的发祥地。

　　1962年6月，中国电子学会电子计算机专业委员会成立，挂靠在计算技术研究所。1966年2月，中国科学院为承担国防部导弹控制系统计算机研制任务，将计算所中与微电子技术有关的研究室分离出去，组建了“中国科学院微电子研究所”。1978年3月，第三研究室从事计算数学（不含计算机辅助设计部分）及部分硬件人员从计算所独立出去，组建了“中国科学院计算中心”。1983年6月至1984年1月，计算所全面调整研究室，将原来13个研究室和计算技术服务社调整成分别从事计算机系统、计算机体系结构、数字系统设计自动化、计算机电源、数据库与信息存储技术、磁记录技术、计算机组装技术、微型机开发及应用、计算机网络、大规模集成电路、集成电路测试技术、数字图像处理、模式信息处理、智能仪器、技术服务、计算机应用和人才开发、动力系统、情报图书、大型计算机、系统软件、软件工程和应用软件、软件理论和技术22个研究室和数理逻辑组、激光组两个研究组。1985年2月，为适应形势，加速发展我国的软件事业，计算所将从事软件研究的研究室调出，成立“中国科学院软件研究所”。6月，中国计算机学会成立，常务办事机构设在计算技术研究所。1985年，国家科委批准中国科学院，同意将半导体、计算所有关研制大规模集成电路部分充实加强到109厂，成立中国科学院微电子中心。

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